復(fù)旦賓大合作團(tuán)隊(duì)歷時(shí)七年揭示非洲人群復(fù)雜演化

中國(guó)教育報(bào)-中國(guó)教育新聞網(wǎng)訊（記者 任朝霞）復(fù)旦大學(xué)與美國(guó)賓夕法尼亞大學(xué)的國(guó)際科學(xué)團(tuán)隊(duì)歷時(shí)7年研究，對(duì)極具代表性的非洲12個(gè)群體的180位個(gè)人進(jìn)行了全基因組測(cè)序分析。日前，相關(guān)研究成果以《全基因組測(cè)序揭示非洲人群的復(fù)雜演化歷程與對(duì)環(huán)境的適應(yīng)性進(jìn)化》為題在線發(fā)表于國(guó)際頂尖期刊《細(xì)胞》（CELL），并登上期刊封面。

論文中研究的12個(gè)非洲人群的分布圖。學(xué)校供圖

盡管有眾多研究表明現(xiàn)代人類(lèi)起源于非洲，且非洲人群不僅具有世界上最豐富的遺傳多樣性和表型多樣性，并且現(xiàn)代人類(lèi)近三分之一的語(yǔ)言都在非洲。然而，目前的遺傳學(xué)和基因組學(xué)的研究中，只有不到3%的樣本來(lái)自非洲，存在嚴(yán)重滯后性。研究非洲人群遺傳多樣性不僅將加深我們對(duì)于現(xiàn)代人類(lèi)起源、早期遺傳結(jié)構(gòu)以及適應(yīng)性進(jìn)化的理解，并且也能為健康和診斷研究及開(kāi)發(fā)提供豐富的新遺傳信息。

基于人類(lèi)參考基因組，研究共發(fā)現(xiàn)3200萬(wàn)個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)（single nucleotide polymorphism, SNP），其中大約530萬(wàn)個(gè)位點(diǎn)是在之前沒(méi)有發(fā)現(xiàn)的。這些新發(fā)現(xiàn)的突變廣泛存在于增強(qiáng)子、啟動(dòng)子以及轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)等基因組功能區(qū)域。

在研究中，科學(xué)家利用鄰近距離法（Neighbor-joining method）對(duì)本研究中的12個(gè)民族，和來(lái)自“千人基因組計(jì)劃”的歐洲人群（CEU）、北方漢族人群（CHB）、托斯卡納人群（TSI）以及來(lái)自“西蒙斯基因組多態(tài)性研究計(jì)劃”中的巴布亞人群（Papuan）進(jìn)行了系統(tǒng)計(jì)劃分析，結(jié)果顯示現(xiàn)代桑人的遺傳學(xué)祖先是現(xiàn)代人類(lèi)最早發(fā)生分歧的一支，隨后發(fā)生分歧的是熱帶雨林小矮人的祖先。

研究團(tuán)隊(duì)還結(jié)合正選擇分析的算法、功能基因組學(xué)手段和方法以及大規(guī)模全基因組關(guān)聯(lián)分析的結(jié)果，對(duì)12個(gè)非洲民族特異的適應(yīng)性進(jìn)化進(jìn)行研究,全面繪制了一幅非洲人群適應(yīng)性進(jìn)化的圖譜。

復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院和人類(lèi)表型組研究院青年研究員樊少華為該論文第一作者，賓夕法尼亞大學(xué)遺傳學(xué)系莎拉·蒂什考夫（Sarah A. Tishkoff）教授為通訊作者。